【大气污染防治】2016年，全市6家火电热电企业11台燃煤机组完成改造整治。推进燃煤锅炉整治，淘汰或清洁能源替代10吨及以下燃煤锅炉1935台。33家重点企业完成VOCs（活泼的一类挥发性有机物）污染治理。淘汰黄标车18578辆。提标改造石油化工、合成树脂等行业粉尘治理，完成燃煤电厂超低排放、化工园区VOCs治理项目、有机化学LDAR（泄漏检测与修复）技术改造等288项任务。在合成纤维制造、合成橡胶制造等连续化生产的化工行业推行LDAR技术，完成有机化学原料、合成纤维、合成橡胶制造等行业LDAR技术改造11项。完成印刷包装、表面涂装、人造板制造、家具制造、塑料制品制造、集装箱制造等VOCs排放重点行业治理项目10项，化工园区VOCs综合治理项目23项，堆场粉尘治理项目6项。推进集装箱、家具、电子产品等涂装行业及建筑内外墙油性涂料改为水性涂料“油改水”试点，完成涂装行业“油改水”试点项目1项。加强秸秆禁烧，实现全市卫星遥感零火点。（李玲）
【重金属污染防治】2016年，市环保局完成《南通市重金属污染综合防治“十三五”规划》编制报批。通州区电镀企业全部关闭，如东县13家电镀企业制定关、停、并、转整治方案；开发区钢丝绳行业废酸污泥资源化利用工程项目、金属制品园区4个集中式酸洗磷化热处理平台项目加快建设。至年底，全市4个集中式地表饮用水水源、3个国控断面、28个省控断面各项重金属指标全部达标，环境质量指标达标率100%。（洪茂）
【化工园区整治】2016年，市经济和信息化委、环保局、发展改革委等部门联合开展化工园区环保专项整治行动，全市六大化工园区制定整治方案，明确依法关闭取缔、强化废水收集和处理、加强废气收集和治理、规范危险废物贮存处置、推进环境敏感目标搬迁、完善环境风险防控体系、开展园区环境生态修复七个方面工作。按照省环境保护委员会办公室《关于印发进一步加强化工园区环境保护工作实施方案的通知》（苏环委办〔2012〕23号）等文件要求，南通市六大化工园区全部完成专项整治，3月通过第三方单位—南京大学环规院组织的考核评估验收。至年底，南通市如皋港化工新材料产业园区、如东沿海经济开发区高科技产业园、南通市经济技术开发区化工园区三大化工园区500米卫生防护距离内存在的环境敏感目标全部搬迁。青龙化工园区500米防护区1481户完成签约，未完成109户中基本达成签约意向20户。启东滨江化工园区防护距离内1579户居民中有18户未拆迁到位。海安精细化工园区卫生防护距离内拆迁居民199户，未拆迁居民66户。海安化工园区预计现址重点企业保留两年生产时间。（李玲）
【扬尘治理】2016年，南通市采取建筑工地扬尘防控普查，开展建筑工地环境专项整治，推进建筑工地“两化”（工地硬化、绿化）建设。全市建筑施工现场围挡实现硬质、连续、封闭，规范物料堆放，工地沙土实现100%覆盖；施工区域主要道路、材料加工区实现地面硬化，出入口规范管理，车辆冲洗及周边道路保洁管理基本到位；新开工项目现场出入口及重要产尘点设置视频监控。全年获评省级标准化文明示范工地78个，评出市级标准化文明示范工地150个。（曹建云）
【畜禽养殖污染治理】2016年，南通市统筹环境保护和畜牧业协调健康发展，出台《关于推进畜禽产业健康发展的意见》（通政办发〔2016〕144号），提出“三个优化、三个鼓励”（优化产业布局，优化业主结构，优化服务体系；鼓励沼气发电并网，鼓励龙头带动，鼓励产业融合）产业发展方向和“三个严格”（严格环境准入，严格污染治理，严格环境执法）污染防治措施。累计推广沼气发电并网项目61个，年处理畜禽粪污350万吨，年新增清洁电能6850万千瓦时，年减排二氧化碳7.9万吨。沼气发电并网获评2015年度江苏省农业农村改革创新成果奖。全市所有县（市、区）均出台禁养区划定文件，禁养区内共有703家养殖场（户）需要关闭搬迁。（蔡建康）
【污染场地修复】2016年，全市有5幅工业企业退役场地开展修复，完成修复总面积11.06万平方米。姚港化工区退役场地、红星路北侧地块、江苏宏信化工地块和原南通柴油机厂地块4幅场地完成污染土壤修复并通过验收，原南通耀荣玻璃厂地块完成主体修复施工。（施卫华）
【排污权交易】至2016年底，全市共完成排污权交易33笔，累计成交金额806.28万元。其中，化学需氧量交易14笔，完成交易量385.611吨，成交金额477.24万元；氨氮交易17笔，完成交易量56.258吨，成交金额309.42万元；氮氧化物交易2笔，完成交易量19.016吨，成交金额19.62万元。（申卫民）
【排污费征收】2016年全市排污费征收1.4亿元，比上年有所提升。其中，市区征收2069.2万元，与上年基本持平。开征施工工地扬尘排污费，全市申报工程108个，其中建筑工程98个、市政公用工程2个、水利工程7个、园林绿化工程1个。至年底，开展考核工程102个，其中建筑工程92个、市政工程2个、水利工程7个、园林绿化工程1个，其中结束考核3个。发出收费通知书2份，实际缴纳1家，到账2645元。（单德贵）